凡病机表现为关窍不利、经络壅阻征象者，皆可选用麝香以开窍散结，使闭塞壅遏之气得以疏通。麝香治热闭证，多与牛黄、冰片、犀角等清热醒神药同用;治寒闭证则配苏合香、安息香、石菖蒲等辛香走窜、辟秽祛痰药同用。中恶心腹暴痛、胀急痞满，可配荜拨、良姜等。血瘀气滞、络脉痹阻，以致遍身疼痛，或闭经不通，或腹中包块，于方药中加麝香适量，效果更为显著。麝香还广泛用治痈疽恶疮、结核肿毒、跌打损伤、瘀肿疼痛，内服外用皆可。内服多入丸散中，一日用量0.03～0.1克。毛壳麝香的外皮--麝香壳供药用，有消肿解毒的功效，可治疔毒肿痛、痈疽疮疖。现代用麝香制成气雾剂或含片舌下给药治疗冠心病、心绞痛。麝香注射液局部注射治淋巴结核。麝香孕妇内服外用均禁忌，气血虚者须慎用。